Учёные описали структуру подварианта RE.2.2: усиленное связывание с ACE2 и новый сайт гликозилирования

Исследование, проведённое лабораторией профессора Гао Джорджа Фу в Институте микробиологии Китайской академии наук (IMCAS), выявило ключевые молекулярные характеристики подварианта RE.2.2, который распространяется после продолжительного периода низкого обнаружения в европейских системах эпиднадзора.

Усиленное связывание с рецептором хозяина

Используя поверхностный плазмонный резонанс (SPR) и криоэлектронную микроскопию (cryo-EM), учёные установили, что рецептор-связывающий домен (RBD) RE.2.2 демонстрирует высокое сродство к человеческому ангиотензин-превращающему ферменту 2 (hACE2). Структурный анализ показал, что обратная мутация R493Q образует дополнительную водородную связь с остатком K31 hACE2, что служит основным фактором повышенного связывания с рецептором.

Диапазон хозяев сопоставим с другими омикронами

Исследователи протестировали взаимодействие RE.2.2 с белками ACE2 различных видов животных. Результаты показали, что спектр видов-хозяев для RE.2.2 был широко сопоставим со спектром омикронных вариантов, использованных для сравнения.

Переформатирование иммунного ускользания

Анализы нейтрализации псевдовируса и связывания продемонстрировали переформатированный ландшафт иммунного ускользания. Хотя RE.2.2 избегал действия нескольких классов антител, некоторые широконейтрализующие антитела, потерявшие активность против более ранних омикронных линий (такие как S2K146 и L4.65), восстановили мощную нейтрализующую способность против RE.2.2. Криоэлектронные ternary-структуры показали, что ключевая замена G446D напрямую облегчает взаимодействие с антителами, что иллюстрирует, что вирусная антигенная эволюция ограничена структурными требованиями.

Новый сайт гликозилирования на шипе

Комплексное гликопротеомное профилирование с использованием жидкостной хроматографии–тандемной масс-спектрометрии (LC-MS/MS) и cryo-EM выявило до 26 N-связанных сайтов гликозилирования на S-тримере. RE.2.2 содержит новый N-связанный сайт гликозилирования в позиции N529 на RBD — изменение, ранее не наблюдавшееся у вариантов SARS-CoV-2. Эта модификация образует межпротомерные водородные связи, которые структурно стабилизируют шип в закрытой конформации, балансируя высокое сродство к рецептору с регулируемым входом вируса в клетку.

Структурные ограничения эволюции

Полученные данные подтверждают правило «O-следует-за-N» гликозилирования белков и подчёркивают скоординированную организацию гликанов в шипах коронавирусов. Исследование демонстрирует, что вирусная эволюция не беспредельна и ограничена структурными требованиями.

Это данные исследования, а не медицинский совет.